Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms