Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GscQ02591 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GscQ02591 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GscQ02591 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GscQ02591 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GscQ02591 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GscQ02591 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GscQ02591 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GscQ02591 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GscQ02591 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GscQ02591 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GscQ02591 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GscQ02591 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GscQ02591 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GscQ02591 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GscQ02591 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GscQ02591 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GscQ02591 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GscQ02591 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GscQ02591 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GscQ02591 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GscQ02591 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GscQ02591 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GscQ02591 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms