Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms