Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms