Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms