Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelpQ01102 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelpQ01102 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelpQ01102 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelpQ01102 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SelpQ01102 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelpQ01102 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelpQ01102 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelpQ01102 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms