Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms