Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms