Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms