Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.3 ms