Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms