Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SeleQ00690 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SeleQ00690 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SeleQ00690 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SeleQ00690 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SeleQ00690 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms