Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms