Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms