Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp9bP98195 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp9bP98195 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp9bP98195 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp9bP98195 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp9bP98195 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp9bP98195 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp9bP98195 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp9bP98195 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp9bP98195 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp9bP98195 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp9bP98195 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp9bP98195 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp9bP98195 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp9bP98195 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp9bP98195 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp9bP98195 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp9bP98195 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp9bP98195 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp9bP98195 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp9bP98195 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp9bP98195 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp9bP98195 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp9bP98195 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp9bP98195 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp9bP98195 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp9bP98195 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms