Protein–RNA interactions for Protein: P97953

Vegfc, Vascular endothelial growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfcP97953 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfcP97953 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfcP97953 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfcP97953 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfcP97953 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfcP97953 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfcP97953 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfcP97953 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfcP97953 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfcP97953 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfcP97953 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfcP97953 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfcP97953 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfcP97953 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VegfcP97953 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VegfcP97953 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VegfcP97953 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VegfcP97953 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VegfcP97953 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms