Protein–RNA interactions for Protein: P97861

Krt86, Keratin, type II cuticular Hb6, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt86P97861 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt86P97861 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt86P97861 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt86P97861 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt86P97861 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt86P97861 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt86P97861 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt86P97861 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt86P97861 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt86P97861 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt86P97861 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt86P97861 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt86P97861 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms