Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AlkP97793 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AlkP97793 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AlkP97793 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AlkP97793 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AlkP97793 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AlkP97793 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AlkP97793 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AlkP97793 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AlkP97793 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AlkP97793 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AlkP97793 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AlkP97793 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AlkP97793 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AlkP97793 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AlkP97793 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AlkP97793 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AlkP97793 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AlkP97793 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AlkP97793 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AlkP97793 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AlkP97793 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AlkP97793 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AlkP97793 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AlkP97793 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AlkP97793 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AlkP97793 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AlkP97793 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AlkP97793 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AlkP97793 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AlkP97793 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AlkP97793 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AlkP97793 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AlkP97793 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AlkP97793 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AlkP97793 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AlkP97793 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AlkP97793 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AlkP97793 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AlkP97793 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AlkP97793 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AlkP97793 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AlkP97793 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AlkP97793 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AlkP97793 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
AlkP97793 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AlkP97793 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
AlkP97793 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
AlkP97793 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AlkP97793 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AlkP97793 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AlkP97793 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AlkP97793 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AlkP97793 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AlkP97793 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AlkP97793 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AlkP97793 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AlkP97793 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AlkP97793 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AlkP97793 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AlkP97793 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AlkP97793 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AlkP97793 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AlkP97793 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AlkP97793 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AlkP97793 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AlkP97793 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AlkP97793 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AlkP97793 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AlkP97793 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AlkP97793 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AlkP97793 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AlkP97793 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
AlkP97793 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
AlkP97793 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AlkP97793 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AlkP97793 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AlkP97793 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AlkP97793 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AlkP97793 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AlkP97793 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AlkP97793 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AlkP97793 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AlkP97793 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AlkP97793 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AlkP97793 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AlkP97793 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AlkP97793 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AlkP97793 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AlkP97793 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AlkP97793 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AlkP97793 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AlkP97793 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AlkP97793 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AlkP97793 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AlkP97793 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AlkP97793 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AlkP97793 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AlkP97793 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AlkP97793 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms