Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cry1P97784 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cry1P97784 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cry1P97784 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cry1P97784 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cry1P97784 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cry1P97784 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cry1P97784 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cry1P97784 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cry1P97784 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cry1P97784 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cry1P97784 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms