Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhodP97348 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhodP97348 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhodP97348 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhodP97348 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhodP97348 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhodP97348 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhodP97348 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhodP97348 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhodP97348 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhodP97348 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhodP97348 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhodP97348 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhodP97348 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhodP97348 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhodP97348 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhodP97348 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhodP97348 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhodP97348 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhodP97348 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhodP97348 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhodP97348 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhodP97348 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RhodP97348 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RhodP97348 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhodP97348 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhodP97348 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhodP97348 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RhodP97348 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhodP97348 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhodP97348 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhodP97348 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhodP97348 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhodP97348 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhodP97348 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhodP97348 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhodP97348 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhodP97348 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhodP97348 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhodP97348 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhodP97348 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhodP97348 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhodP97348 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhodP97348 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhodP97348 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhodP97348 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhodP97348 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhodP97348 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhodP97348 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhodP97348 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhodP97348 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhodP97348 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhodP97348 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhodP97348 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhodP97348 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhodP97348 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhodP97348 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RhodP97348 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RhodP97348 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhodP97348 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RhodP97348 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhodP97348 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhodP97348 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhodP97348 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhodP97348 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms