Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx1P81068 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx1P81068 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx1P81068 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx1P81068 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx1P81068 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx1P81068 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx1P81068 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx1P81068 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms