Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctps1P70698 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctps1P70698 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctps1P70698 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctps1P70698 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctps1P70698 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctps1P70698 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctps1P70698 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctps1P70698 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctps1P70698 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctps1P70698 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctps1P70698 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctps1P70698 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctps1P70698 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms