Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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