Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeboxP70368 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms