Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp3P70281 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms