Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NficP70255 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NficP70255 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NficP70255 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NficP70255 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NficP70255 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NficP70255 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NficP70255 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NficP70255 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NficP70255 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NficP70255 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NficP70255 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NficP70255 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NficP70255 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NficP70255 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NficP70255 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NficP70255 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NficP70255 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NficP70255 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NficP70255 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NficP70255 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NficP70255 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NficP70255 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NficP70255 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NficP70255 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NficP70255 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NficP70255 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NficP70255 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NficP70255 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NficP70255 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NficP70255 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NficP70255 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NficP70255 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NficP70255 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NficP70255 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NficP70255 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NficP70255 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NficP70255 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NficP70255 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NficP70255 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NficP70255 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NficP70255 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NficP70255 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NficP70255 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NficP70255 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NficP70255 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NficP70255 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NficP70255 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NficP70255 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NficP70255 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NficP70255 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NficP70255 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NficP70255 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NficP70255 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NficP70255 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NficP70255 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NficP70255 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NficP70255 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NficP70255 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NficP70255 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NficP70255 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NficP70255 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NficP70255 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NficP70255 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NficP70255 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NficP70255 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NficP70255 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NficP70255 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NficP70255 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NficP70255 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NficP70255 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NficP70255 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NficP70255 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NficP70255 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NficP70255 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NficP70255 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NficP70255 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NficP70255 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NficP70255 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NficP70255 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NficP70255 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NficP70255 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NficP70255 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NficP70255 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NficP70255 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NficP70255 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NficP70255 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NficP70255 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NficP70255 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NficP70255 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NficP70255 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NficP70255 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NficP70255 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NficP70255 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NficP70255 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NficP70255 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NficP70255 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NficP70255 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NficP70255 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NficP70255 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms