Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf6P70196 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf6P70196 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf6P70196 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf6P70196 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf6P70196 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms