Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.6 ms