Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms