Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ElobP62869 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ElobP62869 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ElobP62869 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ElobP62869 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ElobP62869 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ElobP62869 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ElobP62869 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ElobP62869 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ElobP62869 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ElobP62869 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ElobP62869 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ElobP62869 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ElobP62869 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ElobP62869 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ElobP62869 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ElobP62869 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ElobP62869 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ElobP62869 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ElobP62869 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ElobP62869 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ElobP62869 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ElobP62869 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ElobP62869 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ElobP62869 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ElobP62869 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ElobP62869 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ElobP62869 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ElobP62869 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ElobP62869 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ElobP62869 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ElobP62869 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ElobP62869 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ElobP62869 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ElobP62869 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ElobP62869 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ElobP62869 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ElobP62869 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ElobP62869 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ElobP62869 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ElobP62869 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ElobP62869 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ElobP62869 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ElobP62869 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ElobP62869 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ElobP62869 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ElobP62869 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ElobP62869 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ElobP62869 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ElobP62869 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ElobP62869 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ElobP62869 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ElobP62869 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ElobP62869 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ElobP62869 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ElobP62869 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ElobP62869 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ElobP62869 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms