Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms