Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps11P62281 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps11P62281 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps11P62281 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps11P62281 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps11P62281 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms