Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp46P62069 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp46P62069 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp46P62069 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Usp46P62069 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Usp46P62069 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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Usp46P62069 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Usp46P62069 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Usp46P62069 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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