Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abce1P61222 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Abce1P61222 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abce1P61222 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abce1P61222 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms