Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap25P60879 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap25P60879 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap25P60879 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap25P60879 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap25P60879 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap25P60879 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap25P60879 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snap25P60879 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snap25P60879 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snap25P60879 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms