Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp1P60335 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms