Protein–RNA interactions for Protein: P60334

Cdo1, Cysteine dioxygenase type 1, mousemouse

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdo1P60334 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdo1P60334 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms