Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eif3eP60229 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms