Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hps5P59438 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hps5P59438 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hps5P59438 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hps5P59438 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hps5P59438 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hps5P59438 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hps5P59438 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hps5P59438 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms