Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms