Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Csrnp3P59055 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms