Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp1P59054 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms