Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdrg1P59048 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms