Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gsc2P56916 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms