Protein–RNA interactions for Protein: P55284

Cdh5, Cadherin-5, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh5P55284 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh5P55284 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh5P55284 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh5P55284 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh5P55284 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh5P55284 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh5P55284 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh5P55284 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh5P55284 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh5P55284 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh5P55284 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh5P55284 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh5P55284 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh5P55284 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh5P55284 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh5P55284 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh5P55284 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh5P55284 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh5P55284 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh5P55284 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh5P55284 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh5P55284 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh5P55284 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh5P55284 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh5P55284 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh5P55284 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh5P55284 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh5P55284 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh5P55284 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh5P55284 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh5P55284 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh5P55284 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh5P55284 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh5P55284 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh5P55284 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh5P55284 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh5P55284 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh5P55284 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh5P55284 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh5P55284 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh5P55284 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh5P55284 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh5P55284 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh5P55284 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh5P55284 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh5P55284 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh5P55284 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh5P55284 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh5P55284 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh5P55284 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh5P55284 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh5P55284 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh5P55284 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdh5P55284 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh5P55284 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh5P55284 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh5P55284 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh5P55284 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh5P55284 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh5P55284 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh5P55284 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh5P55284 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh5P55284 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh5P55284 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh5P55284 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh5P55284 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh5P55284 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh5P55284 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh5P55284 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh5P55284 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh5P55284 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh5P55284 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh5P55284 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh5P55284 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh5P55284 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh5P55284 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdh5P55284 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh5P55284 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh5P55284 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh5P55284 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh5P55284 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh5P55284 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh5P55284 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh5P55284 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh5P55284 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh5P55284 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh5P55284 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh5P55284 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh5P55284 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh5P55284 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh5P55284 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh5P55284 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh5P55284 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh5P55284 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh5P55284 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh5P55284 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh5P55284 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh5P55284 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh5P55284 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh5P55284 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms