Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms