Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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