Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms