Protein–RNA interactions for Protein: P52963

Epb41l4a, Band 4.1-like protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4aP52963 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41l4aP52963 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms