Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Dbx1P52950 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dbx1P52950 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dbx1P52950 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dbx1P52950 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Dbx1P52950 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Dbx1P52950 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Dbx1P52950 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dbx1P52950 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dbx1P52950 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dbx1P52950 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dbx1P52950 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Dbx1P52950 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Dbx1P52950 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dbx1P52950 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Dbx1P52950 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Dbx1P52950 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Dbx1P52950 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dbx1P52950 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dbx1P52950 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dbx1P52950 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dbx1P52950 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Dbx1P52950 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Dbx1P52950 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Dbx1P52950 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dbx1P52950 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Dbx1P52950 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dbx1P52950 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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